库木塔格沙漠的形成，主要是因为来自天山七角井风口的西南风和来自达坂城风口的东南风，沿途经过长风程，携带着大量沙砾，最后在库木塔格地区相遇碰撞并沉积而成，南面的觉罗塔格山也促成了这两种方向的风力减弱和风沙的沉积。因为环境艰苦、道路险远，库木塔格沙漠在唐代被称为“大患鬼魅碛”，至今还蒙着一层神秘的面纱。